Die Kustodie betreut die Ausstellungen im Historischen Waisenhaus. Sie koordiniert den Bestand und die Pflege der Kunst- und Naturalienkammer sowie ihrer Objekte. Die Mitarbeiter:innen sind Ansprechpartner:innen für Leihanfragen genauso wie für Sammler:innen, Wissenschaftler:innen und Restaurator:innen, die Fragen zur Kunst- und Naturalienkammer oder zu einzelnen Objekten haben. Zudem werden von der Kustodie die Dauerausstellungen sowie regelmäßige Sonderausstellungen im Historischen Waisenhaus und im Francke-Wohnhaus konzipiert und betreut.